Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2986556	2986566	11	21 [0]	[0] 64	arcA	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with ArcB or CpxA

TTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAA  >  minE/2986567‑2986628 |                                                              ttCAACGATAAGAATGTGCGGTGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1917841/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3136110/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3377800/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3331810/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3322654/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3287460/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3265530/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3234784/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3211765/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2489222/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3063805/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3050769/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2945994/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2831304/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:273057/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2661047/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2333738/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3437908/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3499944/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3552936/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3635148/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:3649554/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:378394/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:396001/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:494778/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:516905/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:533594/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:553172/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:574345/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:633805/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:811667/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:872653/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:883464/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1936255/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:105019/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1068831/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1239951/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1300913/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1307080/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:134164/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1357185/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1394984/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1726240/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1835986/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1846626/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1850750/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1860470/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1889963/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1912717/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:10108/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1975636/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1976873/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1989819/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1992261/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:1998063/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2017940/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2051388/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2105043/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2144981/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2219359/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:226888/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2295431/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2319150/62‑1 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGAGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGaaa  <  1:2312973/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAA  >  minE/2986567‑2986628

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑