Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2987371	2987386	16	4 [0]	[0] 56	yjtD	predicted rRNA methyltransferase

TGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACG  >  minE/2987387‑2987439 |                                                     tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATc          >  1:1230868/1‑45 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTacact  >  1:2787485/1‑52 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTacac   >  1:2658499/1‑52 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:344662/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2675326/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:273436/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:282260/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2826523/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2862388/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2875624/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2965442/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:3086172/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:3114285/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:3125000/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:3201486/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:3438857/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:913820/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:3470976/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:3490632/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:3565746/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:37491/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:429054/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:620429/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:641527/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:667859/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:718963/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:798168/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:869020/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:106776/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1789837/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1133361/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:122629/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1268597/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1285118/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1292241/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1314631/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1356404/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1416355/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1571536/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1571623/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1605423/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1645964/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1663867/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2674149/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1814802/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1892418/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1938982/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:199256/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:1995616/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2083601/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2132892/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2312019/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2349743/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2426933/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2448828/1‑53 (MQ=255) tGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACg  >  1:2557688/1‑53 (MQ=255) |                                                     TGATATTATTGATAATATTAAAGTTTTCCCGACATTGGCTGAATCGTTACACG  >  minE/2987387‑2987439

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑