Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	286906	286943	38	40 [0]	[0] 46	clpX	ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease

CCGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGCCC  >  minE/286944‑287002 |                                                           ccGTGACTAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2246855/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCTCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2229640/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2693182/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:1106695/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2820962/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:3115584/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:3178823/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:3198397/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:3372108/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:3409421/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:3413618/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:3596444/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:3608681/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:529982/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:563696/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:603825/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:665697/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:669537/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:675307/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:723120/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:727039/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:7555/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:756946/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:772413/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2654523/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:1016418/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:1135597/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:1295349/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:1458461/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:1475469/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:1551559/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:1861685/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:1996861/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2087866/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2162542/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2165613/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:235083/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:23639/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:240151/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2436559/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2437936/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2458184/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2508872/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2615974/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:2661864/59‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGAAGGCGCGTAAAACCGGTGccc  <  1:856134/59‑1 (MQ=255) |                                                           CCGTGACGAGGCGCTGGATGCTATCGCTAAGAAAGCGATGGCGCGTAAAACCGGTGCCC  >  minE/286944‑287002

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑