Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	296617	296671	55	9 [0]	[0] 30	cof	thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase

TCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGT  >  minE/296672‑296733 |                                                              tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGc             >  1:1696084/1‑51 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCaa           >  1:1926699/1‑53 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCa            >  1:1998129/1‑52 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCgg   >  1:861942/1‑61 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:689772/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:746593/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:804999/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:633739/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:2958791/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:492394/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:366543/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:3526077/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:345996/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:3383679/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:3355223/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:3190809/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:3187679/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:3062283/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:1081319/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:2940677/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:2718960/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:2634007/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:2369160/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:2064332/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:2026025/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:198700/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:1371755/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:1304219/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:1196421/1‑62 (MQ=255) tCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGt  >  1:1114181/1‑62 (MQ=255) |                                                              TCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGGT  >  minE/296672‑296733

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑