Missing coverage evidence...
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AGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGA  >  minE/345321‑345382 |                                                              aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTAccc              >  1:810605/1‑50 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCtat  >  1:1317095/1‑60 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCt    >  1:3533314/1‑60 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCt    >  1:2017432/1‑60 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:465212/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:2084158/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:1946540/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:1916014/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:3444188/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:1776807/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:3573979/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:1107340/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:1591783/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:555804/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:2794579/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:2821857/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTg   >  1:3007696/1‑61 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:3244316/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:3553675/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:3057955/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:3024802/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:3485043/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:2744013/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:3594048/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:3635244/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:588892/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:75275/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:758556/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:785380/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:936804/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1660362/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1203156/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1218033/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1295265/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1394717/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1409866/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:149672/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1525670/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1594652/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1630550/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:2894359/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1879058/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:2067961/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:2073369/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:2593909/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:2602389/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:2763790/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:2856246/1‑62 (MQ=255) aGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGACGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGa  >  1:1731499/1‑62 (MQ=255) |                                                              AGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGA  >  minE/345321‑345382

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑