Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	364126	364190	65	6 [0]	[0] 32	[intD]	[intD]

AGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATC  >  minE/364191‑364254 |                                                                aGGCACCTAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:985230/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTaa                        >  1:3275027/1‑42 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAgcg                 >  1:1620243/1‑49 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGt      >  1:1051645/1‑60 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:1072112/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:978074/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:835416/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:62471/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:567349/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:3544943/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:3245139/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:3207327/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:3093025/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:2874454/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:2817452/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:2772782/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:2730463/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:271559/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:2625849/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:2297305/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:2075248/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:1767315/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:1661129/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:1628386/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:1356847/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:1223254/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCT‑‑TGGGAGTAATc  >  1:2758861/1‑62 (MQ=38) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCCCTTATGGGAGTaa    >  1:2277286/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCGTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:1191515/1‑62 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCATAAGTTAgcg                 >  1:81615/1‑49 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCATAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:2624569/1‑62 (MQ=255) aGGCACAGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTAAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa    >  1:3042934/1‑62 (MQ=255) |                                                                AGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATC  >  minE/364191‑364254

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑