Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	394543	394602	60	23 [0]	[0] 41	ahpC/ahpF	alkyl hydroperoxide reductase, C22 subunit/alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)‑binding

CCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACA  >  minE/394603‑394650 |                                                ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTTAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:2715646/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGgaga        >  1:3289914/1‑42 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAAc   >  1:1703861/1‑47 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:3612517/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:3195424/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:3220298/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:3238996/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:3323670/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:335068/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:3504174/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:35207/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:3527638/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:2887280/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:3633825/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:388791/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:546009/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:635341/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:648821/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:751030/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:779640/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:827738/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:884991/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1896337/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1237228/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1283346/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1399470/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1425418/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1431334/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1487367/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1734029/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1830307/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1865552/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:289075/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:2056937/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:2171720/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:2333587/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:2367408/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:263077/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:2650498/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:2805918/1‑48 (MQ=255) ccGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACa  >  1:1038238/1‑48 (MQ=255) |                                                CCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACA  >  minE/394603‑394650

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑