Missing coverage evidence...
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CCGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTC  >  minE/395685‑395746 |                                                              ccGCACTGCGCCGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:2644676/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGCCGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:1932998/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATcggcg            >  1:735009/1‑52 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:3524460/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:3044680/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:3074049/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:3206323/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:3274/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:3387181/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:3504316/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:3519236/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:2981450/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:527959/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:547409/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:723834/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:764000/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:869495/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:917705/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:3043013/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:1218283/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:2623088/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:2392803/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:2324482/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:2188474/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:2005504/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:1935373/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:1672505/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:1649032/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:1570079/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:1399115/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:1345806/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:1337902/1‑62 (MQ=255) ccGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTc  >  1:1240826/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCGCACTGCGACGGCCCGCTGTTTAAAGGTAAACGCGTAGCGGTTATCGGCGGCGGTAACTC  >  minE/395685‑395746

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑