Missing coverage evidence...
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GCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTGCG  >  minE/423018‑423079 |                                                              gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCTGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2273427/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGc                    >  1:574368/1‑44 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:3109901/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2705707/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:27316/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2769713/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2815330/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:283474/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2842817/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:28774/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2879338/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2641161/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:3183218/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:3198482/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:3554300/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:505757/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:622332/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:634370/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:772797/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:907754/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2095675/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:1133723/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:1271025/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:1404055/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:1634407/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:1637532/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:1682169/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:1728252/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2006793/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:1027012/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2100373/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2113308/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2136258/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2257904/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2434712/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2495811/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2612636/1‑62 (MQ=255) gCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTgcg  >  1:2615102/1‑62 (MQ=255) |                                                              GCAGGTTATCGCCGACAATCACCGTTTCTTCCGAATGCGCCTGCATTTTGTTTAATGCTGCG  >  minE/423018‑423079

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑