Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	445541	445565	25	13 [0]	[0] 36	kdpD	fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

AGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATCC  >  minE/445566‑445627 |                                                              aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:338391/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:103524/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:2808352/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:3034485/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:3114455/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:3133680/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:3351694/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:3358096/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:337510/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:2744346/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:3596638/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:425688/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:556505/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:667695/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:716855/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:863985/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:998771/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:2549334/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:1104795/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:1341829/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:1520438/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:1679528/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:1743385/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:181713/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:1938411/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:2159191/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:2171499/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:2260292/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:2277840/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:229341/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:2452303/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:2491087/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:2660509/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGCGTGATcc  <  1:3393297/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGTGCTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:3581633/62‑1 (MQ=255) aGTCGGGTAGGGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATcc  <  1:10603/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGTCGGGTAGTGTTCAGCACATGCTGACGGATCTCGCTGGCCTGGCGGGCGTGGGGTGATCC  >  minE/445566‑445627

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑