Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	477348	477432	85	10 [0]	[0] 61	mngB/cydA	alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I

CTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGA  >  minE/477433‑477474 |                                          cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCATCCGa  <  1:1541197/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:3397813/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2480313/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2489891/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:24966/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2646569/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2665595/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2673331/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2718676/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:274106/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2744799/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2772535/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2885/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:293301/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:3003955/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:3068971/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:3094849/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2461177/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:3417825/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:3424271/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:3432047/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:3566768/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:400363/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:431088/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:508342/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:594355/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:636762/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:834377/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:861822/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:863363/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:869422/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:197540/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1136491/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1180275/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1212978/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1225900/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1250136/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1258975/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1379870/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1392288/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1392339/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1535812/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1543770/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:180981/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1875607/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1963496/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2479774/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1977873/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1994241/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2059217/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2099255/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2169698/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2209041/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2228717/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2234043/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:227532/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:241645/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2447502/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2453972/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:1003032/42‑1 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTCTATCTTTAATTGCCAACCGa  <  1:2159549/42‑1 (MQ=255) |                                          CTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGA  >  minE/477433‑477474

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑