Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	479599	479603	5	68 [0]	[0] 63	cydB	cytochrome d terminal oxidase, subunit II

CCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACA  >  minE/479604‑479663 |                                                            ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3495468/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2827504/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2846976/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2936195/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3016988/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3049880/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3068803/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3073332/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3125402/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3146857/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3244884/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3281243/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3307301/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3307525/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3383045/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3475211/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2803236/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:3531607/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:360373/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:381182/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:403488/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:439388/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:454683/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:508960/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:574327/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:657658/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:711946/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:755411/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:795004/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:865364/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:928509/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:936963/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1886722/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1031278/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1105095/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1155742/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1179607/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1192116/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1199010/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1240588/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1272731/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1383207/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1495005/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1595678/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1603187/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1777863/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1821341/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1842873/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:100631/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1889087/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:1975763/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2047232/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2067243/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2143098/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2185788/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2245069/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2252568/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2271628/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2372655/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2538797/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2572000/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2646578/60‑1 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACcaca  <  1:2692148/60‑1 (MQ=255) |                                                            CCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACA  >  minE/479604‑479663

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑