Missing coverage evidence...
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CCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAG  >  minE/507226‑507274 |                                                 cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGgcgc             >  1:3426413/1‑38 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGtt    >  1:1067604/1‑47 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTa   >  1:451520/1‑48 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTa   >  1:2413764/1‑48 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:3367189/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:436538/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:395569/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:3595358/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:3586390/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:3582754/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:3463339/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:478462/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:3215090/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:3154763/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:3151442/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:3115850/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:3108579/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2933922/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:504401/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:509185/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:543112/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:546188/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:587403/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:607311/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:608356/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:625557/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:686636/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:698971/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:702749/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:762716/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:864936/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:906812/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:187202/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1025516/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1098491/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1106482/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1267750/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1296000/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1328907/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1424618/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1514368/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1532248/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1542456/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1587763/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1675269/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1769078/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1839131/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2968289/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1911/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:1961813/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2084242/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2115222/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2182090/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:220330/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2209783/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2262358/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2315526/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2334114/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2391419/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:2588530/1‑49 (MQ=255) cccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAg  >  1:101054/1‑49 (MQ=255) |                                                 CCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAG  >  minE/507226‑507274

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑