Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	554435	554438	4	5 [0]	[0] 86	ybiY	predicted pyruvate formate lyase activating enzyme

CTATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGC  >  minE/554439‑554490 |                                                    ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGa           >  1:3232224/1‑43 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3276393/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3595254/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3590923/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3582066/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3567994/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3532587/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3511870/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3438045/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3343581/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3331536/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3293716/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3610918/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3242159/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3224287/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3217313/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3211056/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3186248/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3119827/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1154702/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2891458/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:781492/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:952574/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:940554/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:901369/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:873733/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:85307/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:851490/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:831115/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:797596/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:795145/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3051370/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:721475/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:70113/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:662124/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:5236/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:518526/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:448953/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:426336/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:423845/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3614946/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1750489/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2872751/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1981379/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1953223/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1946936/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1917370/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1871912/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1865045/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1809702/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1802475/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1754043/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:200219/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1635285/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1545998/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1509342/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:144702/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1425726/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1357790/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1184726/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:117044/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1162065/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:1156024/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2582555/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2806277/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2794858/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2788609/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2724240/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2680453/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2641524/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2625918/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2812958/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2508493/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2434161/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2409740/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2379241/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2263072/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2212455/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2138094/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2090428/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGGGc  >  1:3581696/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATATGc  >  1:873572/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAG‑TAGATTGATGTGc  >  1:1726419/1‑51 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATTAAAATACATTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3068980/1‑52 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATT‑AAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:2940568/1‑51 (MQ=255) ctATTTCGTTCAAGCATAAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGc  >  1:3585082/1‑52 (MQ=255) |                                                    CTATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGC  >  minE/554439‑554490

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑