Missing coverage evidence...
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TTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGC  >  minE/602809‑602870 |                                                              ttttTCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:3261516/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCGTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggctttgc  <  1:711594/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:3359344/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2610763/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2642543/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2644722/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2802023/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2813160/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:3003676/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:3132523/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:3241648/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2508110/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:3534265/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:3647943/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:479020/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:480535/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:513668/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:60968/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:666583/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:974856/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:1750620/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:1094218/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:1149213/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:1187608/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:1249537/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:1297917/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:1469605/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:1484157/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:1642270/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:1713743/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:104761/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2033433/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2082528/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2135156/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2243781/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2267205/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2306365/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2365938/62‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc  <  1:2415226/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGC  >  minE/602809‑602870

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑