Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	35299	35318	20	21 [0]	[0] 32	caiC	predicted crotonobetaine CoA ligase:carnitine CoA ligase

CTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAACTC  >  minE/35319‑35379 |                                                             cTTTGCGAATCGCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:3298608/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:2756319/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:884990/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:582954/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:512430/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:3559730/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:3551193/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:3487806/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:346981/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:3303000/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:3298764/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:3122581/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:30558/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:2868741/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:2779452/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:1046398/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:2616453/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:2411009/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:2091242/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:207117/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:1833200/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:1826750/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:1781777/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:1596170/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:1276454/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:1216105/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:1189976/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:109014/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:1061977/1‑59 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAACTc  >  1:2164717/1‑61 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCT‑ATTTAAc    >  1:1048221/1‑58 (MQ=255) cTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCAGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAAc    >  1:676851/1‑59 (MQ=255) |                                                             CTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAACTC  >  minE/35319‑35379

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑