Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	620437	620447	11	16 [0]	[0] 35	rpsA/ihfB	30S ribosomal subunit protein S1/integration host factor (IHF), DNA‑binding protein, beta subunit

ACTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCT  >  minE/620448‑620507 |                                                            aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAAcagcag                 >  1:516775/1‑45 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCt            >  1:2450705/1‑50 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTaa         >  1:3437195/1‑53 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGcc   >  1:3123333/1‑59 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGcc   >  1:736058/1‑59 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGcc   >  1:3610413/1‑59 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGcc   >  1:564678/1‑59 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:54043/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:3471177/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:3607886/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:3637439/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:528575/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:3191180/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:592961/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:665510/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:761940/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:792457/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:872741/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:939720/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:3391735/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:1024087/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:3067571/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:3055077/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:2624127/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:2503018/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:2415026/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:2392546/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:2037654/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:1765307/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:1504881/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:1433100/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:1301703/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:1178361/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:110594/1‑60 (MQ=255) aCTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCt  >  1:1099391/1‑60 (MQ=255) |                                                            ACTAAGGGCGGCTACGGCCGCCCTTAATCAATGCAGCAACAGCAGCCGCTTAATTTGCCT  >  minE/620448‑620507

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑