Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	627155	627167	13	36 [1]	[0] 42	ycaQ	conserved hypothetical protein

ATTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACT  >  minE/627168‑627228 |                                                             aTTTAACCAACGAGAAGGGTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGTTTACTGATTTCGCTAACt  <  1:2052675/61‑1 (MQ=37) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:491418/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:303064/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:3107261/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:3218465/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:3273808/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:3365840/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:3565411/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:383602/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:392037/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:489592/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:3006147/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:59668/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:614227/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:638603/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:673348/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:725127/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:836341/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:859939/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:876568/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:962801/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:987836/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:1950214/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:1322720/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:1390903/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:1507846/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:1673161/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:1698290/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:1707891/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:175907/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:1761346/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:1929313/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:1219068/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:2044591/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:2105001/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:2138716/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:2211511/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:2255520/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:2500074/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:2564999/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:257284/61‑1 (MQ=255) aTTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACt  <  1:2887009/61‑1 (MQ=255) |                                                             ATTAAACCAACGACAACGCTGCAAAAAGGGCTACGTCAGGCGATTACTGATTTCGCTAACT  >  minE/627168‑627228

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑