Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	633011	633033	23	19 [0]	[0] 76	[mukE]–[mukB]	[mukE],[mukB]

CGCGGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGCC  >  minE/633034‑633084 |                                                   cgctGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:410102/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3078252/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3365495/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3304191/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:323167/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3216623/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:317454/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3108199/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3098599/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3088148/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3494421/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3044149/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3033726/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2876472/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2823011/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2804331/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2708981/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2614516/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2551423/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2518007/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:532313/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:986751/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:938217/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:93614/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:916912/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:721293/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:697092/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:665261/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:534082/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1052555/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:470193/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:396753/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3646764/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:361387/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:360448/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3573298/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3539794/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:3500710/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1413522/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1687021/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1681671/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1678517/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1641262/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1611156/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1610662/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:158964/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1494736/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1444641/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1716403/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1387418/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1338163/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1320362/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1184536/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1130608/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1107729/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1063527/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1009819/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:213075/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2491691/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2406969/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2396434/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2372417/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2332649/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2317724/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2314324/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2211305/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2166530/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2097001/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2009224/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1978713/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1968306/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1964119/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1950094/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1825836/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:1758535/51‑1 (MQ=255) cgcgGTAAATTTCGCTCACTGACGCTCATTAACTGGAACGGCTTTTTTGcc  <  1:2497059/51‑1 (MQ=255) |                                                   CGCGGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGCC  >  minE/633034‑633084

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑