Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	668977	669003	27	19 [1]	[0] 23	pqiA	paraquat‑inducible membrane protein A

TTTTCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTG  >  minE/669004‑669065 |                                                              ttttCCTGTTGTTTGTGCAAGTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGtt  <  1:1312418/62‑2 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTGTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:3511508/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:977970/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:1230351/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:908493/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:650582/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:610815/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:490228/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:473060/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:427742/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:3603090/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:3090635/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:3012205/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:2990926/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:2577524/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:2339124/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:2249705/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:2089963/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:1923526/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:1915735/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:1820505/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:1629442/62‑1 (MQ=255) ttttCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTg  <  1:1314544/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTTTCCTGTTGTTTGTGCAACTGGTTCCCGCGTTTTGTCTGATAACCATTCTGTTACTGGTG  >  minE/669004‑669065

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑