Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	671353	671376	24	39 [0]	[0] 74	pqiB	paraquat‑inducible protein B

CCGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTGG  >  minE/671377‑671438 |                                                              ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGttaattgaa                             >  1:3442663/1‑35 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3291661/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3460351/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3419138/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3414934/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3395606/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3376920/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3297271/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:329700/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3481430/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3274018/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3245812/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3087298/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2986847/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2978977/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2974267/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2918676/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2781384/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:458382/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:991976/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:981358/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:951987/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:827614/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:776269/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:606689/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:574360/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:544284/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1165599/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:438063/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:435195/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3648307/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3639438/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3628722/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3613482/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:34905/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:3484383/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1705708/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2197170/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2163474/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2157988/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2129558/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2090183/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2073536/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1850746/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1761026/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2772396/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1696105/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1682163/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1623649/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1369379/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1298541/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1247754/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1198675/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1157213/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2275825/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2772476/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2735928/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2670890/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2593095/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2581415/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2550953/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:250969/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2413909/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2401851/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2384954/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2368256/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:232808/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2296728/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2197181/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTg   >  1:1851182/1‑61 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTg   >  1:999166/1‑61 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGAAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:1744414/1‑62 (MQ=255) ccGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAACTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:31308/1‑62 (MQ=255) ccGAAGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTgg  >  1:2704037/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCGACGGATATGCAGTCAACGTTGCGTGAATTGAATCGCAGCATGCAGGGCTTCCAGCCTGG  >  minE/671377‑671438

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑