Missing coverage evidence...
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AAACGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCATT  >  minE/686465‑686526 |                                                              aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:2848134/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:969796/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:802465/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:688335/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:65696/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:555802/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:423767/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:3593097/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:3580051/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:3279458/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:3253188/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:1064451/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:2728668/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:2676603/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:2407188/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:2369477/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:2014848/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:1913268/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:1658152/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:1398073/62‑1 (MQ=255) aaaCGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCAtt  <  1:1284353/62‑1 (MQ=255) |                                                              AAACGTCCAGACGCGCGCCCGGATTTGCGAAGCTGGCGAATAAGCGCCGCGTGCTAACCATT  >  minE/686465‑686526

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑