Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	692900	692903	4	26 [0]	[0] 50	hyaD	protein involved in processing of HyaA and HyaB proteins

GAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATC  >  minE/692904‑692965 |                                                              gAACAGGCGGGGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3013904/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3515101/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2825419/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2855535/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2902399/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2960442/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3088356/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3090249/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3154840/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3218793/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3297366/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3340783/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3346545/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2765997/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3604229/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:3607614/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:411673/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:554647/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:583459/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:598406/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:741391/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:749889/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:930447/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:986664/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:999506/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2071382/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1204603/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1345871/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1398591/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1426937/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1521861/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1585482/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1779791/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1792688/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1965736/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1994526/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2046212/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2063825/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:1166522/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2171977/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2174509/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2218266/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2301345/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2367952/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2390735/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2393337/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2456152/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2551128/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2717772/62‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGCGATGGCGGAGCTTGCTGGGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATc  <  1:2595810/62‑1 (MQ=255) |                                                              GAACAGGCGGCGCTGGCGCAGCTTGCTGCGTGGGGAATTGTGCCGCAACCGGCTAATGAATC  >  minE/692904‑692965

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑