Missing coverage evidence...
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CAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGT  >  minE/714790‑714851 |                                                              cAGAACATGTAATTCGACGGTGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1237996/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:442574/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:2883283/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:2907039/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:3004648/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:3463751/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:3502010/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:3514713/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:435571/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:436653/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:2674184/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:473931/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:526949/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:665778/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:828957/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:847040/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:87162/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:937805/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1928524/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1182635/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1183304/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1241838/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1495297/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1639354/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1841556/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1865760/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1908127/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1975899/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:2013806/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:203828/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:2072663/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:2428656/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:2652755/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:1011379/62‑1 (MQ=255) cAGAACATGT‑ATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGt  <  1:2721680/61‑1 (MQ=255) |                                                              CAGAACATGTAATTCGACGGGGATATTTTTCAGGCCGAAAATCATGCGGGCTTTGAGGCAGT  >  minE/714790‑714851

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑