Missing coverage evidence...
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ACATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGT  >  minE/739116‑739176 |                                                             aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCt             >  1:1012872/1‑50 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAg   >  1:246240/1‑60 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:966840/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:1005197/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:430812/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:411683/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:3563222/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:3530599/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:314810/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:3088601/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:2985655/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:2794096/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:2710536/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:2678588/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:2567117/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:247427/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:2349788/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:2251581/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:1675687/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:1448759/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:1330769/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:1223445/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:1116727/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:1035607/1‑61 (MQ=255) aCATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGAGGTCAGACGGCTATTCATCCAGt  >  1:1608994/1‑61 (MQ=255) |                                                             ACATTATCCTGCTCAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGT  >  minE/739116‑739176

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑