Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	771752	771802	51	11 [0]	[0] 42	hflD	predicted lysogenization regulator

CTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACA  >  minE/771803‑771841 |                                       cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:472168/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:1186180/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2902598/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:3011750/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:3131066/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:3198007/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:3346464/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:3406192/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:3435248/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:3492844/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:386596/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2844957/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:586266/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:608968/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:635433/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:680923/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:718228/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:74329/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:810581/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:907821/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:945494/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2036352/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:1223811/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:1557313/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:1598936/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:1660285/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:1825798/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:1862029/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:1923515/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:1980174/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:1997422/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:201607/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2793182/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2254241/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2327354/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2380101/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2451877/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2541790/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2607758/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2749603/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:2783675/1‑39 (MQ=255) cTGGTGAGCGAGTTGTTGCACAAGGCGTGCCGACTGACa  >  1:3387729/1‑39 (MQ=255) |                                       CTGGTGAGCGAGTTGTTGCACCAGGCGTGCCGACTGACA  >  minE/771803‑771841

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑