Missing coverage evidence...
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CTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACTT  >  minE/805288‑805330 |                                           cTATCCCGCACTTAAAATCTGAAGCTATATCCTCCGTTGACtt  <  1:946368/43‑1 (MQ=38) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:2642753/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:887468/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:7222/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:689029/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:619070/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:540525/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:521832/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:399968/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:3592837/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:345436/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:3383283/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:3330641/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:3249943/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:2781424/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:119866/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:2530697/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:2298012/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:2160205/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:2123084/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:1933250/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:1856585/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:1774886/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:1744435/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:1727777/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:1711095/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:1705134/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:1578170/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:154435/43‑1 (MQ=255) cTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACtt  <  1:1305081/43‑1 (MQ=255) |                                           CTATCCCGCACTTAAAAGCTGAAGCGATATCCTCCGTTGACTT  >  minE/805288‑805330

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑