Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	55473	55481	9	29 [0]	[0] 18	djlA	DnaJ‑like protein, membrane anchored

CCCGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGT  >  minE/55482‑55543 |                                                              cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:2975548/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:985824/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:985464/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:78089/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:644417/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:541607/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:3421550/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:3284705/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:1094655/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:2789478/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:2748566/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:2560521/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:2261944/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:2150537/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:1864531/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:1719457/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:1333868/1‑62 (MQ=255) cccGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATT‑CAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGt  >  1:3383939/1‑61 (MQ=255) |                                                              CCCGAATGAACGGGCGGTGCTGTATGTCATTGCAGAAGAATTAGGGATCTCCCGCGCTCAGT  >  minE/55482‑55543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑