Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	820227	820317	91	3 [0]	[0] 35	ychA	predicted transcriptional regulator

CGCATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCT  >  minE/820318‑820378 |                                                             cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:3605322/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:278939/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:2885633/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:3084116/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:3169703/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:3182802/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:3453356/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:348557/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:3572614/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1135468/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:384931/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:665391/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:670663/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:699122/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:745788/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:819478/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:82977/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:986250/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1561133/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1091061/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1168174/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1252299/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1276513/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1409781/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1503898/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1505231/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1509902/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1649886/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1678820/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1713678/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:1904372/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:228627/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:2314626/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCt  >  1:2472504/1‑61 (MQ=255) cgcATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATAGACATTTTACTCAAGAtt             >  1:2593394/1‑50 (MQ=255) |                                                             CGCATAAACATATTGTGCTGCATTAATTAATCGACATTTTACTCAAGATTAAGGCGATCCT  >  minE/820318‑820378

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑