Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	828313	828313	1	47 [0]	[0] 11	narX	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL

CGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATCAC  >  minE/828314‑828375 |                                                              cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:2246470/62‑1 (MQ=255) cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:2516891/62‑1 (MQ=255) cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:2669505/62‑1 (MQ=255) cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:2767937/62‑1 (MQ=255) cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:2810746/62‑1 (MQ=255) cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:2847729/62‑1 (MQ=255) cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:2850439/62‑1 (MQ=255) cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:3039195/62‑1 (MQ=255) cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:3435990/62‑1 (MQ=255) cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:3616248/62‑1 (MQ=255) cGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATcac  <  1:805048/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGTGCCGCGATCACCAACGGGTAATACGCCGCGCGGGCAGAGCTGGCAGCCTTTATCATCAC  >  minE/828314‑828375

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑