Missing coverage evidence...
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ATGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCACGG  >  minE/833358‑833418 |                                                             aTGAGCAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:2723294/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:2510122/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:907541/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:810252/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:702821/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:446065/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:3609854/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:3504606/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:3310591/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:3187928/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:3171481/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:30469/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:3011162/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:2950451/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:2760658/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:1095841/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:2485065/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:2484401/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:2373476/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:2243241/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:208563/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:1841143/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:1827304/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:1823295/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:1582495/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:1530824/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:148416/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:1464394/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:1406756/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:1394884/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCAcgg  <  1:13506/61‑1 (MQ=255) aTGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTCATGAAACCGTCAcgg  <  1:3241447/61‑1 (MQ=255) |                                                             ATGAACAGCACTTCTTATTTCTATAACCACTCCAGCCAGTGGCGTTATGAAACCGTCACGG  >  minE/833358‑833418

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑