Missing coverage evidence...
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AATTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGTTT  >  minE/876563‑876624 |                                                              aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGATATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:406710/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:2557509/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:838610/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:497158/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:3524719/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:3502741/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:3180951/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:2856274/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:2840221/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:2811292/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:1118037/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:246755/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:2432171/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:166987/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:1597376/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:1561003/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:1426872/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:1368836/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:1311892/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:1271371/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:1204119/62‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTGCGGTAGAACAAGGCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGttt  <  1:3490841/62‑1 (MQ=255) |                                                              AATTGCCCGTGCGGTAGAACAAGTCTCCACAGAAATGTTCCGCAAAGAGTACGCAGAAGTTT  >  minE/876563‑876624

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑