Missing coverage evidence...
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GGCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGT  >  minE/893392‑893453 |                                                              ggCGTCAGTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1160841/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1954293/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:969045/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:708467/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:380659/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:3517100/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:3297308/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:3247966/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:320767/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:3068194/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:3037784/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:2993150/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:2920189/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:2488101/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:2326657/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:2132945/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:2067499/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1858796/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1836340/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1799008/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1792897/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1683735/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1666192/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1662005/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1625300/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:16043/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1598570/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1557739/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:131150/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:1304685/62‑1 (MQ=255) ggCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGt  <  1:126836/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGCGTCACTATAAAATTTGCGCCAGGCGGTACGCAGCGTGCCCGGCGGGCGCTTTTCGCTGT  >  minE/893392‑893453

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑