Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	980082	980250	169	10 [0]	[0] 33	[cspI]	[cspI]

AAAACCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAATTATTAC  >  minE/980251‑980313 |                                                               aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAAc                              >  1:1079642/1‑35 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCa                        >  1:818580/1‑41 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCAttt                     >  1:1375958/1‑44 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:615617/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:3182689/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:3263982/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:3311810/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:3324544/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:3448529/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:37771/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:452699/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:2964114/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:626765/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:634754/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:739383/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:840008/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:84645/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:847448/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:3100701/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:2961504/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:2947458/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:2529740/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:2368893/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:228852/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:2235935/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:2226936/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:1802022/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:1705781/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:165834/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:1601619/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:1462114/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAAttatta   >  1:1343963/1‑62 (MQ=255) aaaaCCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTG‑TAGACATAATTATTAc  >  1:2881505/1‑62 (MQ=255) |                                                               AAAACCTTTTTCAGGGTTAAACCATTTCACTAAACCAGTCATTTTGTTAGACATAATTATTAC  >  minE/980251‑980313

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑