Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	996340	996351	12	12 [0]	[0] 41	dgsA/ynfL	DNA‑binding transcriptional repressor/predicted DNA‑binding transcriptional regulator

AACAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAATTT  >  minE/996352‑996386 |                                   aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:422771/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:3077655/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:3115935/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:3240060/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:3261463/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:3302936/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:3460773/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:3503081/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:3596618/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:397065/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:3071462/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:494901/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:496549/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:591831/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:746443/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:769791/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:862501/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:921149/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:985189/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:989116/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2249437/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:1345722/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:1350182/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:1426425/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:1659855/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:1773823/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:1883816/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2028805/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2078194/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:221607/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:1083736/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2304610/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2330370/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2521713/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2529665/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2563876/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2595673/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2785133/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2861880/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAAttt  <  1:2917747/35‑1 (MQ=255) aaCAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTAAAAttt  <  1:717152/35‑1 (MQ=255) |                                   AACAGCACATTTTTCGGGCTTTTTCGCTGAAATTT  >  minE/996352‑996386

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑