Missing coverage evidence...
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TTAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTATTTT  >  minE/999453‑999514 |                                                              ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:2221434/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:812495/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:3347762/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:3094321/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:301850/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:297455/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:2875427/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:259972/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:249909/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:2343003/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:2244165/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:1092839/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:2203930/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:2008189/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:1893111/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:1874879/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:1804834/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:1630564/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:162584/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:1436598/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:1316687/62‑1 (MQ=255) ttAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTAtttt  <  1:1226138/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTAGCGGAGGGTAGTATGGTGGGCCGTTATCGCTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTATTTT  >  minE/999453‑999514

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑