Missing coverage evidence...
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CCGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCG  >  minE/1024778‑1024838 |                                                             ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:2567310/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:789064/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:716794/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:514101/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:378326/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:3529128/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:3472454/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:3392617/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:3318395/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:3205570/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:3150289/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:1073308/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:224455/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:2105674/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:2094648/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:2093245/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:2090164/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:2016870/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:1668965/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:1613982/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:1433799/61‑1 (MQ=255) ccGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCg  <  1:1214405/61‑1 (MQ=255) |                                                             CCGCGTTGTCAGGTGAGCGCCTATCATTGCTGTTGAATAGTGCGAAGGCACACTCTATTCG  >  minE/1024778‑1024838

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑