Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1032346	1032400	55	10 [0]	[0] 63	[blr]	[blr]

CGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAA  >  minE/1032401‑1032439 |                                       cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:3607954/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2729944/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2739326/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2786821/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2853988/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2858536/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2878539/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:29223/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:3045761/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:3165914/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:3218245/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:3220337/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:3485552/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:349137/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:3515888/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:3562157/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2694121/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:409784/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:425277/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:646665/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:675919/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:705844/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:777268/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:810849/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:859981/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:877978/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:890799/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:895451/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:92020/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:92500/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:940885/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1691758/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1036196/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1160937/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1170083/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1172237/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:11740/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:123418/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1353854/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1392685/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1429269/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1436558/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1576465/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1673254/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1683613/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1020640/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2379793/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:263643/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2634434/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2578538/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2517918/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2480216/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2458763/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:2458603/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:241432/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1906431/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1840836/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1759486/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1752674/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa  >  1:1733996/1‑39 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGa   >  1:1728235/1‑38 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGa   >  1:1465647/1‑38 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGa   >  1:592610/1‑38 (MQ=255) |                                       CGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAA  >  minE/1032401‑1032439

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑