Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 79052 79189 138 5 [0] [1] 91 murE UDP‑N‑acetylmuramoyl‑L‑alanyl‑D‑glutamate:meso‑ diaminopimelate ligase

GACGATAACCCGCGTACCGAAGAACCGCGTGCCATCATCAACGATATTCTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAC  >  minE/79142‑79251
                                                |                                                             
gacgATAACCCGCGTACCGAAGAACCGCGTGCCATCATCAACGATATTCTGGCGGGAAt                                                     >  1:2775586/1‑59 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTCGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:659467/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGTACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1886359/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGGTGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:233490/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAg                     >  1:847968/1‑43 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAATCGGTGAc  >  1:2960874/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGt     >  1:1766080/1‑59 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTgga  >  1:2945796/1‑60 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTg    >  1:2388608/1‑60 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGa   >  1:2595591/1‑61 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGa   >  1:3338071/1‑61 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGa   >  1:1115243/1‑61 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2817457/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3144938/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3002463/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:842603/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2947001/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:843153/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2945555/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2914408/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2861198/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3239547/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2788222/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:277601/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:866262/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:892742/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2706524/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2690699/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2606580/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2486747/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3438534/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:652923/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:572552/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:570103/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:492507/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:382289/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3638567/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:350190/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3489646/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3449449/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:683868/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3423855/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3372756/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:683904/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3356215/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:754174/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:775182/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3288831/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:3259731/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1275362/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1700762/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1682005/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1640523/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1625973/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:162238/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1498849/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1433220/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:142820/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1298861/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1291084/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1759080/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1241429/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1215220/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1166690/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:114887/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1133637/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1117911/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1077157/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:106856/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1036344/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2214345/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:24978/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1034251/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:237780/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2349763/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:234799/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:231856/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:231585/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2297426/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2254921/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2569724/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2182861/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2097390/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2095647/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1999267/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1950613/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:18875/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1813611/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1783587/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:1759684/1‑62 (MQ=255)
                                                cTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGACAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAc  >  1:2401949/1‑62 (MQ=255)
                                                |                                                             
GACGATAACCCGCGTACCGAAGAACCGCGTGCCATCATCAACGATATTCTGGCGGGAATGTTAGATGCCGGACATGCCAAAGTGATGGAAGGCCGTGCTGAAGCGGTGAC  >  minE/79142‑79251

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: