Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1038795	1038855	61	3 [0]	[0] 39	rsxE	predicted inner membrane NADH‑quinone reductase

GCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCTT  >  minE/1038856‑1038913 |                                                          gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:3482877/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:2610608/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:2690028/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:2832791/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:285093/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:3136489/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:3190162/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:32495/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:3401107/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:3432052/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:2580351/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:3560730/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:3615608/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:567910/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:845284/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:849303/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:868208/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:931548/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:935163/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:968196/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1745350/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1053572/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1231229/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1231601/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1255767/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1295853/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1400041/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1437713/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1548543/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1569314/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:101337/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1818110/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:1928420/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:2026169/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:2121750/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:2314938/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:2315872/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:255152/58‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCtt  <  1:256579/58‑1 (MQ=255) |                                                          GCCGCGCTGAAGCCTTCGCCGCCAAAAAAGGTCCGGCGCTTTCGGCACTGGACGGCTT  >  minE/1038856‑1038913

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑