Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1046794	1046804	11	3 [0]	[1] 5	ydhH	conserved hypothetical protein

CACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCCAGCAGCGCATGATGGAACGCAGGTACCAGCGGTGCGCCTT  >  minE/1046799‑1046866       |                                                              cACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCCAGCAGCGCATGATGGAACGCAGGTACCAGCGGTg        <  1:783605/62‑1 (MQ=255)       tcgtcgCTCGGTTGGGTGAGCCAGCAGCGCTTGATGGAACGCAGGTACCAGCGGTGCGCCtt  <  1:701438/62‑1 (MQ=255)       tcgtcgCTCGGTTGGGTGAGCCAGCAGCGCATGATGGAACGCAGGTACCAGCGGTGCGCCtt  <  1:1392867/62‑1 (MQ=255)       tcgtcgCTCGGTTGGGTGAGCCAGCAGCGCATGATGGAACGCAGGTACCAGCGGTGCGCCtt  <  1:1947418/62‑1 (MQ=255)       tcgtcgCTCGGTTGGGTGAGCCAGCAGCGCATGATGGAACGCAGGTACCAGCGGTGCGCCtt  <  1:2249358/62‑1 (MQ=255)       |                                                              CACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCCAGCAGCGCATGATGGAACGCAGGTACCAGCGGTGCGCCTT  >  minE/1046799‑1046866

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑