Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1072660	1072776	117	2 [0]	[0] 80	ydhQ	conserved hypothetical protein

GCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAG  >  minE/1072777‑1072819 |                                           gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCa   >  1:1685759/1‑42 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2780884/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3194966/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3129196/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:310080/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3061983/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2930904/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2863089/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2836027/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2834156/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3198700/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2579625/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2572184/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2494667/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2449878/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2410849/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2338097/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2319927/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2177357/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1013864/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:475109/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:851721/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:768439/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:741968/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:732886/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:596070/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:550896/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:547117/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:511583/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:496464/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2173369/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:449735/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:412844/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3476320/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3388295/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3383580/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3328152/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3295689/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3258358/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3233731/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1356664/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2157333/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1457025/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1456596/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1420915/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1405218/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1392801/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1391398/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1389849/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1383880/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1466051/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1324381/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:126196/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1232307/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1220316/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1193751/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1103109/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1084813/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1044869/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1819848/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2094573/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2072546/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2038391/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:2024997/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1977382/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1956729/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1938651/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1879596/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1566118/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1785178/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1750447/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1747438/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1722495/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1715980/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1676504/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:1623430/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACAATTCAg  >  1:3555222/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGATTTCCACCATTCAg  >  1:2033664/1‑43 (MQ=255) gCGTTGCCGCATCAGAGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCa   >  1:1989897/1‑42 (MQ=255) gCGTGGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAg  >  1:3272779/1‑43 (MQ=255) |                                           GCGTTGCCGCATCAGTGATCAGCCACAGTTTTCCACCATTCAG  >  minE/1072777‑1072819

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑