Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1085865	1085884	20	84 [0]	[0] 48	ynhG	conserved hypothetical protein

GTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGT  >  minE/1085885‑1085925 |                                         gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACt        >  1:1141043/1‑35 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3461833/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1088550/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3024826/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3026553/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3036221/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3061691/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3104290/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3157524/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3162122/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3259635/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3369970/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3433690/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:2988474/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3513000/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:361457/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:363917/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:512061/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:666598/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:752773/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:806487/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:905145/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:966520/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:981607/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1786902/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1096422/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1144598/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1343870/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1395594/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1404751/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1406192/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1469512/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1665868/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1674612/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:2881032/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1887091/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:1941121/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:198886/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:2007956/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:2062075/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:2270383/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:2364726/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:2478057/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:2514607/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:2591967/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:2680595/1‑41 (MQ=255) gTCCTAGCGGGTTATTTGGTCC‑GCAGGAACGACTGGCGGt  >  1:3522164/1‑40 (MQ=39) gTCCTAGCGGGTTATATGGTCCGGCAGGAACGACTgg      >  1:667226/1‑37 (MQ=255) |                                         GTCCTAGCGGGTTATTTGGTCCGGCAGGAACGACTGGCGGT  >  minE/1085885‑1085925

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑