Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1124159	1124272	114	10 [0]	[0] 99	pheT	phenylalanine tRNA synthetase, beta subunit

TATCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGC  >  minE/1124273‑1124332 |                                                            tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTcac  <  1:1304616/60‑3 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3070271/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3302106/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3282069/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:327995/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3274950/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:327204/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3261732/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3255215/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3236571/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3153152/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:314090/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3133065/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3074931/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:331665/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3005582/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2951150/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2879034/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2776315/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2720149/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2720024/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2665783/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2628684/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2603655/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2603546/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2589810/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:592051/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:986481/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:921886/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:905440/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:870925/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:806348/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:750719/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:727481/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:708455/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:692516/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:671390/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:604009/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2558998/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:525124/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:465213/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:406222/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:393867/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:357857/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3529195/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3519967/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3516522/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3421000/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3406519/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:3359231/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1341952/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1614315/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1611966/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1592342/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1577990/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1559935/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1551166/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1515300/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1498397/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1408525/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1390323/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1386748/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1617356/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:126364/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1262258/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1203852/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1197810/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1139117/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1109645/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1104665/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1042319/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1037390/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1029374/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1009223/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1669267/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2512913/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2493948/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2441954/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2437779/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2200286/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2185995/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2179483/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2172068/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2135200/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2115110/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:2017548/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1858087/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1831173/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1798646/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1793737/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1779983/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1772925/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1751878/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1711153/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1693104/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:168138/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGc  <  1:1007968/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCATCGGTCACTTCGc  <  1:1354322/60‑1 (MQ=255) tatCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGACTTCGGTCACTTCGc  <  1:307875/60‑1 (MQ=255) |                                                            TATCGAAACGCCAGCTCGGCGCAACTGCCTGCCATTCGTCTTTGCCTTCGGTCACTTCGC  >  minE/1124273‑1124332

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑