Missing coverage evidence...
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TAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGG  >  minE/1127465‑1127523 |                                                           tAATTAAAAAGTTAAAAACTTTAACGGCTTATGCGTACggc                    >  1:374458/1‑41 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTAc                       >  1:1515796/1‑38 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:935707/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:1406339/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:3498090/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:3435050/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:3363884/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:3334076/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:3098019/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:2945617/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:2772101/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:2707759/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:2688152/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:2684524/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:2398029/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:2336704/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:1827581/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAgg  >  1:1675981/1‑59 (MQ=255) tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAg   >  1:1816029/1‑58 (MQ=255) |                                                           TAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGG  >  minE/1127465‑1127523

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑