Missing coverage evidence...
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CATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCT  >  minE/1134465‑1134525 |                                                             cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGGAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:3340020/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:979816/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:1226432/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:775715/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:709293/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:594602/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:500622/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:466651/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:450738/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:3571207/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:357107/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:3523556/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:3519369/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:3369029/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:3251449/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:3251101/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:2915699/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:2906007/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:2164676/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:2125723/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:2082743/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:2066/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:2055515/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:1675785/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:1286760/61‑1 (MQ=255) cATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCt  <  1:1242667/61‑1 (MQ=255) |                                                             CATAAGCGGAAGCCTGCCGCCAGGTGTGAAGCTGGAAAAATTAACCCAACTGATTTCCGCT  >  minE/1134465‑1134525

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑