Missing coverage evidence...
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AAAGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCCG  >  minE/1134625‑1134685 |                                                             aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGCACTCCCCCAGCCGGCCGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:1766941/1‑61 (MQ=38) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCAccc                          >  1:2708344/1‑37 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCg                     >  1:3057501/1‑42 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:857763/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:1022665/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:823048/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:570574/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:3407858/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:3375804/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:3337593/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:3130029/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:3000005/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:2985175/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:2900533/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:2841629/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:25093/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:2504817/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:2462672/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:2145489/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:1881136/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:1784803/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:1748846/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:126739/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:1179072/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:1104722/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:1076503/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCcg  >  1:1071016/1‑61 (MQ=255) aaaGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCCGa                   >  1:3592388/1‑44 (MQ=255) |                                                             AAAGAACTCAGTGCGCTGGTGAATCGCGAACTCACCCAGCCGGACGATGTCCGCAAAGCCG  >  minE/1134625‑1134685

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑