Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1144123	1144213	91	162 [0]	[1] 43	chbG	conserved hypothetical protein

AAACGCCGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGC  >  minE/1144209‑1144275      |                                                              atccGCCGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGGCATCCAg         <  1:3200752/57‑1 (MQ=255)      ccGTATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1218854/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATTACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2513100/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCTGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2272632/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGTACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:3030672/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTTCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1623067/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:3187163/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2382421/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2425206/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2498678/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2566441/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2569214/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2584588/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2685218/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2717234/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2311821/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:3380720/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:388297/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:464633/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:669965/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:819052/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:914635/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:989524/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:18062/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1196061/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1440548/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1479734/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:150408/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1599672/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1669856/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1749016/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1764896/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1781197/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2367445/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1873559/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1875060/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1904386/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1938848/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:209187/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2208998/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:1164660/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGc  <  1:2333879/62‑1 (MQ=255)      ccGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGGCATCCAGCACTTGc  <  1:2052575/62‑1 (MQ=255)      |                                                              AAACGCCGGATGACACATCACCTCCAGCGAACGATCACCCCGATGGCCTGCGTCATCCAGCACTTGC  >  minE/1144209‑1144275

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑