Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1147826	1147834	9	16 [0]	[0] 52	chbC	N,N'‑diacetylchitobiose‑specific enzyme IIC component of PTS

CATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAT  >  minE/1147835‑1147894 |                                                            cATCAGCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1669386/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCATACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1634713/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACATAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1039201/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:398046/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3246167/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3261014/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3299415/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3362164/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3369229/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3402788/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3417890/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3455533/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3495097/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3518084/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:368217/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:382263/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:3160534/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:431506/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:499494/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:533950/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:539510/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:598090/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:613657/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:623244/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:683378/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:846631/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:896972/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:928332/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1904007/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1051928/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:105870/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1253553/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1298877/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1314133/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1318358/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:146094/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1464237/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1558732/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1639967/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:180348/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:322882/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1926150/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:1933395/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:2037849/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:2135251/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:2258871/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:2262681/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:2354533/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:2366782/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:2477966/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:2671693/60‑1 (MQ=255) cATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAt  <  1:2865697/60‑1 (MQ=255) |                                                            CATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCTGGAAGAT  >  minE/1147835‑1147894

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑