Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1149866	1149892	27	7 [0]	[0] 32	osmE	DNA‑binding transcriptional regulator

CCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGT  >  minE/1149893‑1149954 |                                                              ccATCATGGTTAATAACGCCGCTGCTCTCAGAATTCCt                          >  1:318198/1‑38 (MQ=25) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCat         >  1:2125298/1‑55 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTcc    >  1:1417821/1‑60 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCg   >  1:934674/1‑61 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCg   >  1:1088306/1‑61 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:791910/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:858622/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:735791/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:631909/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:3647061/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:3219774/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:892133/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:3174157/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:892472/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:2879164/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:2744472/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:2432967/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:2714896/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:2269815/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:2168823/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:2074311/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:1959799/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:1944623/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:1645467/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:1550251/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:1262990/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:1261728/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:1171767/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:1166989/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:1099034/1‑62 (MQ=255) ccAGCATGGTTAATACAGCCGCTGCACTCAGAATTCATGCCATATTCTTGTTCATATTcc    >  1:199315/1‑60 (MQ=255) ccAGCATGGGTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGt  >  1:351858/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGT  >  minE/1149893‑1149954

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑